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产品介绍


发现和鉴定新病毒以及确定新病毒与疾病的关系是预防、诊断和治疗新发病毒性传染病的首要任务。高通量测序技术突破了传统技术方法的局限,可以直接以标本中所有的遗传物质为研究对象,从而能够快速地鉴定出标本中存在的病毒,形成了一门研究特定环境中病毒群落的新兴学科:病毒宏基因组学(宏病毒组)

传统意义上有很多用于发现新病毒的方法,如病毒分离、核酸检验、血清学试验等,但它们都有一定的局限性。但利用高通量测序发现新病毒具有信息量大、对标本所含信息无偏倚、操作较简单、检测成本较低等独特优点,使得该技术已成为目前病毒发现的重要技术之一,其在病毒诊断、溯源、预警等方面具有实用意义。

病毒宏基因组测序,又叫宏病毒组测序(Virome),是直接以环境样本中所有病毒的遗传物质为研究对象,进行病毒分析生物学检测的技术,能够快速准确的鉴定出环境中所有病毒的组成,在病毒发现、病毒溯源、微生物预警研究等方面有重要作用。

2018年,全球病毒组计划 (The Global Virome Project) 启动,旨在鉴定出地球上大部分未知病毒。丰富病毒参考数据库如NCBIJGI,构建新的海洋病毒数据库(GOV)。病毒组序列鉴定分类,对于研究病毒与宿主功能互作意义重大!



技术流程


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分析策略


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应用范围


  • 直接或间接参与地球生物化学循环

  • 调控寄主群落结构

  • 病毒与寄主共进化推动地球生态系统的多样性



宏病毒样本类型及要求


样本类型

体积或质量

可检测核酸范围(纳克)

海水DNA病毒

100

20-200

人类粪便DNA病毒

500毫克

500-3000

人类粪便RNA病毒

500毫克

140-500

海洋沉积物DNA病毒

1

50-100

微生物DNA病毒

1

50-100

珊瑚组织DNA病毒

1

60-100



分析示例


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发表时间文章标题杂志名影响因子合作单位
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2023Rhizosphere phage communities drive soil
suppressiveness to bacterial wilt disease
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2023Combined virome analysis and metagenomic sequencing to reveal the viral communities and risk of virus-associated antibiotic resistance genes during compostingJournal of Hazardous Materials13.6中国热带农业科学院
2023Virus impacted community adaptation in oligotrophic groundwater environment revealed by Hi-C coupled metagenomic and viromic studyJournal of Hazardous Materials13.6南方科技大学
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2024Phages in sludge from the A/O wastewater treatment process play an important role in the transmission of ARGsScience of the Total Environment9.8聊城大学
2024The bacteriome-coupled phage communities continuously contract and shift to orchestrate the traditional rice vinegar fermentationFood Research International8.1浙江工商大学
2024The bacteriome-coupled phage communities continuously contract and
shift to orchestrate the traditional rice vinegar fermentation
Food Research International8.1浙江省工商大学
2022Virioplankton assemblages from Challenger Deep, the deepest place in the oceansiScience7.396中国海洋大学
2022Diversity and potential functional characteristics of phage communities colonizing microplastic biofilmsEnvironmental Research6.498河海大学
2021Saline lakes on the Qinghai-Tibet Plateau harbor unique viral assemblages mediating microbial environmental adaptioniScience5.458中国海洋大学